Я не профессионал, но исходя из того, что я знаю, дело в каких-то выводах контроллера памяти, которые отвечают за обмен данными при определении устройства. Соответственно при плохой пропайке эти контакты, во время нагрева могут терять контакт с платой (что видимо происходит при работе устройства)соответственно «флешке» требуется охлаждение.
Попробуйте разобрать «флешку» и пропаять контакты контроллера памяти.
А лучше задайте вопрос на
там скорее всего,вам дадут более профессиональный совет.
). После того как остынет работает как ни в чём не бывало. до того момента пока вновь не будет извлечена, после чего процедуру охлаждения требуется повторять. 
