Опять же клиент не причём, сам .torrent хватается без проблем, проблема его получить.
Выкинул из системы вообще все профили файера, и вернул обратно текущие из бэкапа. Переключил в настройках "выдавать запрос на сохранение" и файер стал сохранять торрент файл. Затем переключил на папку для сохранения и поставил автоматический запуск ассоциированной программы - всё благополучно закачалось и запустилось. Однако DownThemAll по прежнему не работает. В принципе можно и без него обойтись, но с ним удобно, если нужно сохранить торрент в папку отличной от дефолтной.