Попробуйте, сохранять не всю папку, поскольку в ней могут остаться настройки от предыдущей версии, а сохранить только торрент файлы. После переустановки клиента, переместить их обратно (возможно, загрузки не будут отображаться в клиенте, тогда придётся кликать по каждому файлу, запуская загрузку в клиенте).
Ещё как вариант, (подробно описать его не смогу, просто подкину идею для размышления) установите другой клиент, после установки предложит, перенести загрузки с другого клиента, соглашайтесь, если такого запроса не было придётся искать самому, (в меню или настройках).
После того как переместите загрузки, удаляйте uTorrent и чистьте реестр, устанавливайте новый uTorrent (или стабильную версию какую рекомендуют) и перемещайте свои загрузки уже на него.
P.S
Прежде чем всё это делать, напишите модератору техподдержки в
личку, может это можно исправить другими средствами, менее сложными.
Удачи вам ваших делах !!!