И всё-же FFmpeg использовал для перекодировки JPEG 2000 в ProRes 4444 с альфа-каналом и белым фоном когда альфа отключена. Лёгкой и бесплатной альтернативы ffmpeg найти не смог. Нашёл в интернете вариант с батником, его и использовал. Для теста, кому интересно будет, могут попробовать такой вариант:
Код: выделить все ffmpeg -i %_inputfile% -vf chromakey=blue:similarity=0.1 -c:v prores_ks -profile:v 4 -vendor apl0 -bits_per_mb 8000 -pix_fmt yuva444p10le -y %_outputfile% |
Он наиболее приближен к оригиналу из того что протестировал методом проб и ошибок изучая ffmpeg. Можно добавить дополнительные параметры и ещё поиграться с настройками перекодировки.